Pracujeme na obnovení aplikace Unionpedia v Google Play Store
OdchozíPřicházející
🌟Zjednodušili jsme náš design pro lepší navigaci!
Instagram Facebook X LinkedIn
Vaše vlastní Uniepedie s vaším logem a doménou, od 9,99 USD/měsíc
Vytvořit můj Uniepedie

Bioconductor

Index Bioconductor

Bioconductor je bioinformatický software vyvinutý pro analýzu velkoobjemových genomických dat.

Obsah

  1. 2 vztahy: Ape (balíček programu R), R (programovací jazyk).

Ape (balíček programu R)

ape (zkratka pro anglický název Analysis of Phylogenetics and Evolution) je balík pro fylogenetické analýzy pro prostředí R. Tento balík poskytuje funkce pro čtení, psaní, kreslení a manipulaci s fylogenetickými stromy, vytváření konsensuálních stromů a výpočet druhových stromů (Species tree) z genových stromů (Gene tree), analýzy srovnávacích dat ve fylogenetickém rámci, analýzy rodových znaků, analýzy diverzifikace a makroevoluce, výpočty vzdálenosti z sekvencí DNA, čtení a psaní nukleotidových sekvencí stejně jako importování z BioConductoru či GenBank a několik nástrojů, jako je Mantelův test, generalizované panoramatické výkresy, grafický průzkum fylogenetických dat, odhad absolutních evolučních rychlostí a odhad míry speciace a extinkce pomocí birth-death modelu, datování stromů za použití ancient DNA, manipulaci se sekvencemi DNA a jejich překládání do sekvencí aminokyselin, vyhodnocení sekvenčního uspořádání stejně jako výpočet frekvencí jednotlivých nukleotidů.

Vidět Bioconductor a Ape (balíček programu R)

R (programovací jazyk)

R je programovací jazyk a prostředí určené pro statistickou analýzu dat a jejich grafické zobrazení.

Vidět Bioconductor a R (programovací jazyk)