Pracujeme na obnovení aplikace Unionpedia v Google Play Store
OdchozíPřicházející
🌟Zjednodušili jsme náš design pro lepší navigaci!
Instagram Facebook X LinkedIn
Vaše vlastní Uniepedie s vaším logem a doménou, od 9,99 USD/měsíc
Vytvořit můj Uniepedie

Protein threading

Index Protein threading

Protein threading, nebo také rozpoznávání foldů, je metoda užívaná při modelování proteinů, které mají stejný fold, jako nějaký protein známé struktury.

Obsah

  1. 15 vztahy: Aktin, Alignment (biologie), Aminokyselina, ATPáza, Bílkovina, Dynamické programování, Homologní modelování, Janet Thornton, Protein Data Bank, Protein teplotního šoku, Rentgenová krystalografie, Science, Skrytý Markovův model, Spektroskopie nukleární magnetické rezonance, Templát.

Aktin

ADP Aktin je globulární strukturní protein, který polymeruje v dlouhá vlákna zvaná mikrofilamenta (F-aktin).

Vidět Protein threading a Aktin

Alignment (biologie)

Alignment (někdy ekvivalentně sekvenční alignment) je základní bioinformatický nástroj, spočívající v seřazení dvou i více sekvencí DNA, RNA nebo proteinu pod sebe tak, aby odpovídající si nukleotidové báze či aminokyselinové zbytky ležely pod sebou.

Vidět Protein threading a Alignment (biologie)

Aminokyselina

Amminoacido glicina formula.svg|alt.

Vidět Protein threading a Aminokyselina

ATPáza

Na+/K+ ATPáza, čili sodno-draselná pumpa ATPáza (adenosin trifosfatáza) je označení pro enzym, který katalyzuje hydrolýzu ATP na ADP a fosfát, případně hydrolýzu ATP na AMP a pyrofosfát.

Vidět Protein threading a ATPáza

Bílkovina

Trojrozměrná struktura proteinu Bílkoviny, odborně proteiny (z řeckého próteios „prvotní, primární, hlavní“), patří mezi biopolymery.

Vidět Protein threading a Bílkovina

Dynamické programování

Dynamické programování je metoda pro efektivní řešení určitých optimalizačních úloh.

Vidět Protein threading a Dynamické programování

Homologní modelování

Homologní modelování, také komparativní či knowledge-based modelování, je metoda konstrukce struktury neznámého proteinu na základě jeho aminokyselinové sekvence a na základě znalosti struktury homologního proteinu (tzv.

Vidět Protein threading a Homologní modelování

Janet Thornton

Janet Maureen Thornton (* 23. května 1949) je britská bioinformatička a vedoucí vědecká pracovnice Evropského institutu bioinformatiky (EBI), který je součástí Evropské laboratoře molekulární biologie (EMBL).

Vidět Protein threading a Janet Thornton

Protein Data Bank

Příklad struktury v PDB databázi. Na obrázku molekula měsíce (březen 2000) DNA polymeráza Protein Data Bank (zkráceně PDB) je primární databáze 3-D struktur makromolekul jako např.

Vidět Protein threading a Protein Data Bank

Protein teplotního šoku

Funkce hsp70 (francouzsky) - chaperonová aktivita Protein teplotního šoku (hsp – heat shock protein) je označení pro skupinu proteinů, které zajišťují univerzální stresovou odpověď buněk, například při vystavení buňky vysoké teplotě, extrémnímu pH nebo třeba těžkým kovům.

Vidět Protein threading a Protein teplotního šoku

Rentgenová krystalografie

Klasické difrakční spektrum práškového materiálu Rentgenová strukturní analýza (v biochemii často nazývána rentgenová krystalografie,,, nebo) je analytická metoda zabývající se studiem interakce krystalických vzorků s rentgenovým zářením, která umožňuje určit absolutní strukturu molekul, tj.

Vidět Protein threading a Rentgenová krystalografie

Science

Science (věda) je akademický časopis Americké asociace pro rozvoj vědy a je považován za jeden ze světově nejprestižnějších vědeckých časopisů.

Vidět Protein threading a Science

Skrytý Markovův model

Skrytý Markovův model (angl. HMM) je statistický Markovův model, který modeluje systém za předpokladu, že jde o Markovův proces se skrytými (nepozorovanými) stavy.

Vidět Protein threading a Skrytý Markovův model

Spektroskopie nukleární magnetické rezonance

Spektroskopie nukleární magnetické resonance neboli NMR spektroskopie (zkratka NMR pochází z angl. Nuclear magnetic resonance (spectroscopy)) je fyzikálně-chemická metoda využívající interakce atomových jader (s nenulovým jaderným spinem, např.

Vidět Protein threading a Spektroskopie nukleární magnetické rezonance

Templát

Templát či též matrice je v molekulární biologii označení pro jednořetězcovou DNA (někdy i jednořetězcovou RNA), který je využíván jako zdroj informací při tvorbě kopií těchto nukleových kyselin.

Vidět Protein threading a Templát