24 vztahy: Aminokyselina, Ape (balíček programu R), Bayesovská statistika, Clustal, Druh, Fenotyp, Fylogenetika, Fylogeneze, Genotyp, Genový tok, Heuristické algoritmy, Horizontální přenos genetické informace, Matice, Mutace, Příbuzenství, Phytools, Poslední společný předek, R (programovací jazyk), Reprodukční izolace, RRNA, Sekvence nukleové kyseliny, Speciace, Strom, Taxon.
Aminokyselina
Amminoacido glicina formula.svg|alt.
Nový!!: Fylogenetický strom a Aminokyselina · Vidět víc »
Ape (balíček programu R)
ape (zkratka pro anglický název Analysis of Phylogenetics and Evolution) je balík pro fylogenetické analýzy pro prostředí R. Tento balík poskytuje funkce pro čtení, psaní, kreslení a manipulaci s fylogenetickými stromy, vytváření konsensuálních stromů a výpočet druhových stromů (Species tree) z genových stromů (Gene tree), analýzy srovnávacích dat ve fylogenetickém rámci, analýzy rodových znaků, analýzy diverzifikace a makroevoluce, výpočty vzdálenosti z sekvencí DNA, čtení a psaní nukleotidových sekvencí stejně jako importování z BioConductoru či GenBank a několik nástrojů, jako je Mantelův test, generalizované panoramatické výkresy, grafický průzkum fylogenetických dat, odhad absolutních evolučních rychlostí a odhad míry speciace a extinkce pomocí birth-death modelu, datování stromů za použití ancient DNA, manipulaci se sekvencemi DNA a jejich překládání do sekvencí aminokyselin, vyhodnocení sekvenčního uspořádání stejně jako výpočet frekvencí jednotlivých nukleotidů.
Nový!!: Fylogenetický strom a Ape (balíček programu R) · Vidět víc »
Bayesovská statistika
Bayesovská statistika je větev relativně moderní statistiky, která pracuje s podmíněnými pravděpodobnostmi a dovoluje zpřesňovat pravděpodobnost výchozí hypotézy, jak se objevují další relevantní skutečnosti.
Nový!!: Fylogenetický strom a Bayesovská statistika · Vidět víc »
Clustal
Základní metoda z roku 1994 (Thompson, 1994) Sekvenční alignment (Chenna, 2003) Fylogenetický strom vytvořený Clustal W (Chenna, 2003) Program Clustal je široce využívaný v molekulární biologii na (MSAs).
Nový!!: Fylogenetický strom a Clustal · Vidět víc »
Druh
Druh (species, zkratka sp.) je základní kategorie biologické nomenklatury.
Nový!!: Fylogenetický strom a Druh · Vidět víc »
Fenotyp
Ukázka fenotypů mlžů druhu ''Donax variabilis –'' různorodé zbarvení a vzorování Fenotyp (starořecky φαίνω phaíno „objevuji se“ a τύπος týpos „tvar, podoba, vzor“) je soubor všech pozorovatelných vlastností a znaků živého organismu.
Nový!!: Fylogenetický strom a Fenotyp · Vidět víc »
Fylogenetika
přirozené taxony, zpravidla odmítá parafyletismus a polyfyletismus Fylogenetika je obor systematické biologie, který se snaží najít vývojové vztahy mezi organizmy.
Nový!!: Fylogenetický strom a Fylogenetika · Vidět víc »
Fylogeneze
Fylogeneze (z řec. fylé.
Nový!!: Fylogenetický strom a Fylogeneze · Vidět víc »
Genotyp
Část molekuly DNA, která je nositelkou genetické informace Genotyp (starořecky γένος génos „rod, pohlaví“ a τύπος týpos „tvar, podoba, vzor“) je soubor všech genů, přesněji alel, daného organismu.
Nový!!: Fylogenetický strom a Genotyp · Vidět víc »
Genový tok
Genový tok je přesun alel z jedné populace do jiné způsobený pohybem jedinců. V tomto příkladu jeden z ptáků populace A imigroval do populace B, která má více dominantních alel a skrze páření své alely začlenil do sousední populace V populační genetice znamená genový tok či tok genů (v angličtině gene flow) přesun alel genů z jedné populace do druhé.
Nový!!: Fylogenetický strom a Genový tok · Vidět víc »
Heuristické algoritmy
Heuristické algoritmy jsou takové algoritmy, které při svém výpočtu používají heuristiku.
Nový!!: Fylogenetický strom a Heuristické algoritmy · Vidět víc »
Horizontální přenos genetické informace
Fylogenetický strom s zaznačenými proudy genetické informace v rámci HGT Horizontální přenos genetické informace (také laterální genový transfer či jiné kombinace těchto slov, zkratky HGT a LGT) je proces, při němž jeden organismus přijímá genetický materiál (DNA) jiného jedince, ačkoliv není jeho potomkem.
Nový!!: Fylogenetický strom a Horizontální přenos genetické informace · Vidět víc »
Matice
Matice typu m \times n: obsahuje m vodorovných řádků a n svislých sloupců. Prvky matice se značí proměnnou se dvěma dolními indexy. Například a_21 představuje prvek na druhém řádku a v prvním sloupci matice. Matice je v matematice obdélníkové či čtvercové schéma čísel nebo nějakých matematických objektů – prvků matice (též elementů matice).
Nový!!: Fylogenetický strom a Matice · Vidět víc »
Mutace
Mutace je změna genotypu.
Nový!!: Fylogenetický strom a Mutace · Vidět víc »
Příbuzenství
Rodinný strom ukazující příbuzenství.(Úplně dole Carl Gustaf Bielke švédský sběratel knih) Příbuzenství je hlavním principem organizace jednotlivců do sociálních skupin, rolí a kategorií.
Nový!!: Fylogenetický strom a Příbuzenství · Vidět víc »
Phytools
Phytools (rozříšený název zní phytools: An R package for phylogenetic comparative biology (and other things)) je soubor programů pro fylogenetické analýzy ve statistickém programovacím jazyku R.
Nový!!: Fylogenetický strom a Phytools · Vidět víc »
Poslední společný předek
Poslední společný předek (MRCA - z anglického Most Recent Common Ancestor) jakékoliv sady organismů je jedinec, který je přímým předkem všech organismů dané skupiny, a přitom tuto vlastnost už nemá žádný jeho potomek.
Nový!!: Fylogenetický strom a Poslední společný předek · Vidět víc »
R (programovací jazyk)
R je programovací jazyk a prostředí určené pro statistickou analýzu dat a jejich grafické zobrazení.
Nový!!: Fylogenetický strom a R (programovací jazyk) · Vidět víc »
Reprodukční izolace
#PŘESMĚRUJReprodukční bariéra.
Nový!!: Fylogenetický strom a Reprodukční izolace · Vidět víc »
RRNA
malé ribozomální podjednotky) rRNA neboli ribosomální RNA je druh RNA, který se podílí, spolu se specifickými bílkovinami, na tvorbě ribozomu.
Nový!!: Fylogenetický strom a RRNA · Vidět víc »
Sekvence nukleové kyseliny
Rozdíl mezi nukleovými kyselinami RNA a DNA Sekvence nukleové kyseliny je posloupnost nukleových bází, které jsou součástí nukleotidů a ty jsou zase základní stavební jednotkou deoxyribonukleové kyseliny (DNA) a ribonukleové kyseliny (RNA).
Nový!!: Fylogenetický strom a Sekvence nukleové kyseliny · Vidět víc »
Speciace
schéma jednotlivých typů speciace kladistických stromů Speciace je evoluční proces vzniku nových biologických druhů (latinsky species).
Nový!!: Fylogenetický strom a Speciace · Vidět víc »
Strom
Nejvyšší strom světa – sekvoj vždyzelená Borovice pinie Ovocné stromy se pěstují pro plody (např. hruška) Tříděné a omítané řezivo (Dřevo je velmi důležitou surovinou) V botanice je strom vytrvalá rostlina s prodlouženým dřevnatým stonkem nebo kmenem, který u většiny druhů nese větve a listy.
Nový!!: Fylogenetický strom a Strom · Vidět víc »
Taxon
Taxon neboli systematická jednotka neboli taxonomická jednotka je základním pojmem taxonomie, oboru, který se zabývá klasifikací prvků systémů.
Nový!!: Fylogenetický strom a Taxon · Vidět víc »