Logo
Uniepedie
Sdělení
Nyní na Google Play
Nový! Ke stažení Uniepedie na vašem zařízení se systémem Android™!
Stažení
Rychlejší přístup než prohlížeči!
 

Fylogenetický strom

Index Fylogenetický strom

Strom života je fylogenetický strom, na jehož patě je poslední univerzální společný předek. Tento je založen na průzkumu rRNA Horizontální přenos genetické informace strom života zesložiťuje. Fylogenetický strom („strom života“) je grafické zobrazení připomínající strom, jímž se znázorňují příbuzenské vztahy mezi různými biologickými druhy či jinými taxonomickými jednotkami, o nichž se předpokládá, že mají jednoho společného předka.

24 vztahy: Aminokyselina, Ape (balíček programu R), Bayesovská statistika, Clustal, Druh, Fenotyp, Fylogenetika, Fylogeneze, Genotyp, Genový tok, Heuristické algoritmy, Horizontální přenos genetické informace, Matice, Mutace, Příbuzenství, Phytools, Poslední společný předek, R (programovací jazyk), Reprodukční izolace, RRNA, Sekvence nukleové kyseliny, Speciace, Strom, Taxon.

Aminokyselina

Amminoacido glicina formula.svg|alt.

Nový!!: Fylogenetický strom a Aminokyselina · Vidět víc »

Ape (balíček programu R)

ape (zkratka pro anglický název Analysis of Phylogenetics and Evolution) je balík pro fylogenetické analýzy pro prostředí R. Tento balík poskytuje funkce pro čtení, psaní, kreslení a manipulaci s fylogenetickými stromy, vytváření konsensuálních stromů a výpočet druhových stromů (Species tree) z genových stromů (Gene tree), analýzy srovnávacích dat ve fylogenetickém rámci, analýzy rodových znaků, analýzy diverzifikace a makroevoluce, výpočty vzdálenosti z sekvencí DNA, čtení a psaní nukleotidových sekvencí stejně jako importování z BioConductoru či GenBank a několik nástrojů, jako je Mantelův test, generalizované panoramatické výkresy, grafický průzkum fylogenetických dat, odhad absolutních evolučních rychlostí a odhad míry speciace a extinkce pomocí birth-death modelu, datování stromů za použití ancient DNA, manipulaci se sekvencemi DNA a jejich překládání do sekvencí aminokyselin, vyhodnocení sekvenčního uspořádání stejně jako výpočet frekvencí jednotlivých nukleotidů.

Nový!!: Fylogenetický strom a Ape (balíček programu R) · Vidět víc »

Bayesovská statistika

Bayesovská statistika je větev relativně moderní statistiky, která pracuje s podmíněnými pravděpodobnostmi a dovoluje zpřesňovat pravděpodobnost výchozí hypotézy, jak se objevují další relevantní skutečnosti.

Nový!!: Fylogenetický strom a Bayesovská statistika · Vidět víc »

Clustal

Základní metoda z roku 1994 (Thompson, 1994) Sekvenční alignment (Chenna, 2003) Fylogenetický strom vytvořený Clustal W (Chenna, 2003) Program Clustal je široce využívaný v molekulární biologii na (MSAs).

Nový!!: Fylogenetický strom a Clustal · Vidět víc »

Druh

Druh (species, zkratka sp.) je základní kategorie biologické nomenklatury.

Nový!!: Fylogenetický strom a Druh · Vidět víc »

Fenotyp

Ukázka fenotypů mlžů druhu ''Donax variabilis –'' různorodé zbarvení a vzorování Fenotyp (starořecky φαίνω phaíno „objevuji se“ a τύπος týpos „tvar, podoba, vzor“) je soubor všech pozorovatelných vlastností a znaků živého organismu.

Nový!!: Fylogenetický strom a Fenotyp · Vidět víc »

Fylogenetika

přirozené taxony, zpravidla odmítá parafyletismus a polyfyletismus Fylogenetika je obor systematické biologie, který se snaží najít vývojové vztahy mezi organizmy.

Nový!!: Fylogenetický strom a Fylogenetika · Vidět víc »

Fylogeneze

Fylogeneze (z řec. fylé.

Nový!!: Fylogenetický strom a Fylogeneze · Vidět víc »

Genotyp

Část molekuly DNA, která je nositelkou genetické informace Genotyp (starořecky γένος génos „rod, pohlaví“ a τύπος týpos „tvar, podoba, vzor“) je soubor všech genů, přesněji alel, daného organismu.

Nový!!: Fylogenetický strom a Genotyp · Vidět víc »

Genový tok

Genový tok je přesun alel z jedné populace do jiné způsobený pohybem jedinců. V tomto příkladu jeden z ptáků populace A imigroval do populace B, která má více dominantních alel a skrze páření své alely začlenil do sousední populace V populační genetice znamená genový tok či tok genů (v angličtině gene flow) přesun alel genů z jedné populace do druhé.

Nový!!: Fylogenetický strom a Genový tok · Vidět víc »

Heuristické algoritmy

Heuristické algoritmy jsou takové algoritmy, které při svém výpočtu používají heuristiku.

Nový!!: Fylogenetický strom a Heuristické algoritmy · Vidět víc »

Horizontální přenos genetické informace

Fylogenetický strom s zaznačenými proudy genetické informace v rámci HGT Horizontální přenos genetické informace (také laterální genový transfer či jiné kombinace těchto slov, zkratky HGT a LGT) je proces, při němž jeden organismus přijímá genetický materiál (DNA) jiného jedince, ačkoliv není jeho potomkem.

Nový!!: Fylogenetický strom a Horizontální přenos genetické informace · Vidět víc »

Matice

Matice typu m \times n: obsahuje m vodorovných řádků a n svislých sloupců. Prvky matice se značí proměnnou se dvěma dolními indexy. Například a_21 představuje prvek na druhém řádku a v prvním sloupci matice. Matice je v matematice obdélníkové či čtvercové schéma čísel nebo nějakých matematických objektů – prvků matice (též elementů matice).

Nový!!: Fylogenetický strom a Matice · Vidět víc »

Mutace

Mutace je změna genotypu.

Nový!!: Fylogenetický strom a Mutace · Vidět víc »

Příbuzenství

Rodinný strom ukazující příbuzenství.(Úplně dole Carl Gustaf Bielke švédský sběratel knih) Příbuzenství je hlavním principem organizace jednotlivců do sociálních skupin, rolí a kategorií.

Nový!!: Fylogenetický strom a Příbuzenství · Vidět víc »

Phytools

Phytools (rozříšený název zní phytools: An R package for phylogenetic comparative biology (and other things)) je soubor programů pro fylogenetické analýzy ve statistickém programovacím jazyku R.

Nový!!: Fylogenetický strom a Phytools · Vidět víc »

Poslední společný předek

Poslední společný předek (MRCA - z anglického Most Recent Common Ancestor) jakékoliv sady organismů je jedinec, který je přímým předkem všech organismů dané skupiny, a přitom tuto vlastnost už nemá žádný jeho potomek.

Nový!!: Fylogenetický strom a Poslední společný předek · Vidět víc »

R (programovací jazyk)

R je programovací jazyk a prostředí určené pro statistickou analýzu dat a jejich grafické zobrazení.

Nový!!: Fylogenetický strom a R (programovací jazyk) · Vidět víc »

Reprodukční izolace

#PŘESMĚRUJReprodukční bariéra.

Nový!!: Fylogenetický strom a Reprodukční izolace · Vidět víc »

RRNA

malé ribozomální podjednotky) rRNA neboli ribosomální RNA je druh RNA, který se podílí, spolu se specifickými bílkovinami, na tvorbě ribozomu.

Nový!!: Fylogenetický strom a RRNA · Vidět víc »

Sekvence nukleové kyseliny

Rozdíl mezi nukleovými kyselinami RNA a DNA Sekvence nukleové kyseliny je posloupnost nukleových bází, které jsou součástí nukleotidů a ty jsou zase základní stavební jednotkou deoxyribonukleové kyseliny (DNA) a ribonukleové kyseliny (RNA).

Nový!!: Fylogenetický strom a Sekvence nukleové kyseliny · Vidět víc »

Speciace

schéma jednotlivých typů speciace kladistických stromů Speciace je evoluční proces vzniku nových biologických druhů (latinsky species).

Nový!!: Fylogenetický strom a Speciace · Vidět víc »

Strom

Nejvyšší strom světa – sekvoj vždyzelená Borovice pinie Ovocné stromy se pěstují pro plody (např. hruška) Tříděné a omítané řezivo (Dřevo je velmi důležitou surovinou) V botanice je strom vytrvalá rostlina s prodlouženým dřevnatým stonkem nebo kmenem, který u většiny druhů nese větve a listy.

Nový!!: Fylogenetický strom a Strom · Vidět víc »

Taxon

Taxon neboli systematická jednotka neboli taxonomická jednotka je základním pojmem taxonomie, oboru, který se zabývá klasifikací prvků systémů.

Nový!!: Fylogenetický strom a Taxon · Vidět víc »

OdchozíPřicházející
Ahoj! Jsme na Facebooku teď! »